國民政府遷台後，其行政制度大致承襲日人所設，唯對日治時期的「蕃地」分散成三十個山地鄉，並將其納入民政部門，適用一般法令，享有一般國民權利。民國36年（1947）6月臺灣省政府民政廳通報將「高山族」改稱為「山地同胞」，冠上「山地」二字，主為便於實施特別的山地行政加以保護，並依照地理環境，編組成30個山地鄉162個村，除蘭嶼鄉係孤立臺東外海的小島外，其餘29鄉皆屬本島山地脊樑地帶。至於原居於「蕃地」以外的原住民族，則因為日治時期已納入普通行政區，故歸於一般鄉鎮管理。而這兩類的區別便是「山地山胞」與「平地山胞」的籠統劃分。

至於相關的山地行政，悉依平地規定辦理，特別是原由警察主管的教育、授產、醫療、交易等項工作，分別移歸有關單位接辦。當初日人各級警察機關內勤的「理蕃」機構，悉予撤銷，並將原有分室、駐在所改為派出所。民國37年，為加強山地督導，特將山地衝要點之派出所改為分駐所，以較高層級單位管理之。

統計至民國42年8月止，當時共有288個派出所，52個分駐所，較之與日治時代的駐在所與警力分佈，明顯可見其分佈點的縮減。當初日人在管理蕃地上動員的蕃務官警共有5166人，除辦理教育、衛生、交易及其他雜物工作外，直接辦理警務工作者尚有1543人。國民政府遷台後，不僅駐在所荒廢許多，受限於經費與人員配置，山地警力，大見減少，全省的山地警官只有781人，分配全省53個分駐所，235間派出所，184各查驗戰，471個警備區，控制17045.972方里的山地，兩者相較，明顯可看出國民政府遷台之初，其山地政策與對山地區域大致沿襲自日人的制度與設施，唯在編制資源上卻不及日治時期的嚴謹與區隔。